Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms