Protein–RNA interactions for Protein: Q80XG9

Lrrtm4, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 4, mousemouse

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm4Q80XG9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrtm4Q80XG9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lrrtm4Q80XG9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lrrtm4Q80XG9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm4Q80XG9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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