Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lamp3Q7TST5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lamp3Q7TST5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lamp3Q7TST5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lamp3Q7TST5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lamp3Q7TST5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lamp3Q7TST5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lamp3Q7TST5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lamp3Q7TST5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lamp3Q7TST5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lamp3Q7TST5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lamp3Q7TST5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lamp3Q7TST5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lamp3Q7TST5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lamp3Q7TST5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lamp3Q7TST5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lamp3Q7TST5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lamp3Q7TST5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lamp3Q7TST5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lamp3Q7TST5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lamp3Q7TST5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lamp3Q7TST5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lamp3Q7TST5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Lamp3Q7TST5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Lamp3Q7TST5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lamp3Q7TST5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lamp3Q7TST5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lamp3Q7TST5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lamp3Q7TST5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lamp3Q7TST5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Lamp3Q7TST5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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