Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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LnpkQ7TQ95 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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LnpkQ7TQ95 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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LnpkQ7TQ95 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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