Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp397Q7TNK4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms