Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TwistnbQ78WZ7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms