Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SpopQ6ZWS8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms