Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Syne2Q6ZWQ0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms