Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CtifQ6PEE2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms