Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms