Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2aQ6P4T0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms