Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RbfaQ6P3B9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms