Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tpm4Q6IRU2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms