Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbf1Q6DFZ1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gbf1Q6DFZ1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms