Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cep170Q6A065 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep170Q6A065 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms