Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd9lQ69Z37 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd9lQ69Z37 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms