Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pkp4Q68FH0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pkp4Q68FH0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pkp4Q68FH0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pkp4Q68FH0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pkp4Q68FH0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pkp4Q68FH0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pkp4Q68FH0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pkp4Q68FH0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Pkp4Q68FH0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Pkp4Q68FH0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Pkp4Q68FH0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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