Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CltcQ68FD5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CltcQ68FD5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms