Protein–RNA interactions for Protein: Q62392

Phlda1, Pleckstrin homology-like domain family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phlda1Q62392 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phlda1Q62392 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phlda1Q62392 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms