Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttf1Q62187 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
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Ttf1Q62187 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttf1Q62187 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Ttf1Q62187 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttf1Q62187 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Ttf1Q62187 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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