Protein–RNA interactions for Protein: Q61330

Cntn2, Contactin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn2Q61330 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn2Q61330 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms