Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcf4Q60722 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms