Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim41Q5NCC3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms