Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps41Q5KU39 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms