Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SynaQ5G5D5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms