Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkaa1Q5EG47 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms