Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufaf2Q59J78 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufaf2Q59J78 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms