Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Snx25Q3ZT31 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Snx25Q3ZT31 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Snx25Q3ZT31 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms