Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp48Q3V0C5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp48Q3V0C5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms