Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm5aQ3UXZ9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms