Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BB287469Q3UT53 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms