Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mccc2Q3ULD5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms