Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Edc4Q3UJB9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms