Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zyg11bQ3UFS0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms