Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Arhgef38-204ENSMUST00000161932 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf166Q3U9F6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms