Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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