Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms