Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q3U6N9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Q3U6N9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q3U6N9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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