Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LcorlQ3U285 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LcorlQ3U285 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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LcorlQ3U285 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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