Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Palb2Q3U0P1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms