Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hace1Q3U0D9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hace1Q3U0D9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms