Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
InipQ3TXT3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms