Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc102aQ3TMW1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms