Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smarca4Q3TKT4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms