Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb38Q3LR78 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb38Q3LR78 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb38Q3LR78 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb38Q3LR78 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb38Q3LR78 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbtb38Q3LR78 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbtb38Q3LR78 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbtb38Q3LR78 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zbtb38Q3LR78 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb38Q3LR78 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms