Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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Shroom4Q1W617 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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Shroom4Q1W617 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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Shroom4Q1W617 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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Shroom4Q1W617 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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Shroom4Q1W617 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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Shroom4Q1W617 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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Shroom4Q1W617 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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Shroom4Q1W617 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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Shroom4Q1W617 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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Shroom4Q1W617 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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Shroom4Q1W617 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shroom4Q1W617 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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Shroom4Q1W617 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
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Shroom4Q1W617 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shroom4Q1W617 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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