Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Tdrd9Q14BI7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Tdrd9Q14BI7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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Tdrd9Q14BI7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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Tdrd9Q14BI7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tdrd9Q14BI7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tdrd9Q14BI7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms