Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Itgb8Q0VBD0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Itgb8Q0VBD0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Itgb8Q0VBD0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Itgb8Q0VBD0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Itgb8Q0VBD0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Itgb8Q0VBD0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Itgb8Q0VBD0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Itgb8Q0VBD0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Itgb8Q0VBD0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Itgb8Q0VBD0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Itgb8Q0VBD0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Itgb8Q0VBD0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Itgb8Q0VBD0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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