Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms