Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ttc21bQ0HA38 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms